{"id":102959,"date":"2020-10-27T16:36:00","date_gmt":"2020-10-27T20:36:00","guid":{"rendered":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/importance-des-reunions-de-laboratoire-pour-le-developpement-des-competences-en-recherche-scientifique\/"},"modified":"2020-10-27T16:36:00","modified_gmt":"2020-10-27T20:36:00","slug":"importance-des-reunions-de-laboratoire-pour-le-developpement-des-competences-en-recherche-scientifique","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/importance-des-reunions-de-laboratoire-pour-le-developpement-des-competences-en-recherche-scientifique\/","title":{"rendered":"Importance des r\u00e9unions de laboratoire pour le d\u00e9veloppement des comp\u00e9tences en recherche scientifique"},"content":{"rendered":"<p><span class=\"c3\"><span class=\"c2\"><em><strong>Par Fredj Tekaia et Abdellatif Boudabous &#8211;<\/strong><\/em><\/span><\/span> La publication des r\u00e9sultats d\u2019un travail scientifique est une \u00e9tape vitale dans le d\u00e9veloppement du cursus d\u2019un chercheur. Il lui est n\u00e9cessaire de (i) lire et analyser la litt\u00e9rature scientifique dans les meilleurs journaux, (ii) pr\u00e9senter oralement son propre travail ou les contenus de ses lectures afin d\u2019enrichir les autres et de s\u2019enrichir \u00e0 travers leurs commentaires et critiques. Ces activit\u00e9s soulignent l\u2019importance du suivi de l\u2019actualit\u00e9 scientifique, la lecture critique des publications et la capacit\u00e9 de synth\u00e9tiser leurs contenus et de les pr\u00e9senter publiquement. Cette d\u00e9marche permet de formuler une opinion, de commenter et \u00e9changer avec d\u2019autres coll\u00e8gues sur le contenu d\u2019une publication scientifique.<\/p>\n<p>Lire, \u00e9crire, publier et pr\u00e9senter publiquement des travaux scientifiques sont des comp\u00e9tences primordiales pour le d\u00e9veloppement du profil et de la carri\u00e8re de tout jeune chercheur. Cependant, ces comp\u00e9tences ne font g\u00e9n\u00e9ralement pas partie des enseignements formels d\u00e9livr\u00e9s par les Universit\u00e9s. Elles peuvent plut\u00f4t faire partie des activit\u00e9s r\u00e9guli\u00e8res de certains groupes sp\u00e9cialis\u00e9s : Laboratoires, Instituts et Centres de recherche.<\/p>\n<p>Nous avons pens\u00e9, \u00e0 l\u2019occasion de cette rentr\u00e9e universitaire particuli\u00e8re marqu\u00e9e par la crise sanitaire et suite \u00e0 notre r\u00e9cente publication1, attirer l\u2019attention des jeunes chercheurs et enseignants sur l\u2019importance de l\u2019organisation du suivi de l\u2019actualit\u00e9 scientifique, de pr\u00e9sentation de travaux et de discussion scientifique r\u00e9guli\u00e8re au sein des \u00e9quipes de recherche, Laboratoires et Institutions universitaires.<\/p>\n<p>Nous nous concentrons ici sur nos exp\u00e9riences personnelles ant\u00e9rieures, et sur notre exp\u00e9rience acquise lors des cours de formation de jeunes chercheurs\u00a0 en \u00ab Bioinformatique et G\u00e9nomique \u00bb \u00e0 l\u2019Institut Pasteur de Tunis2.\u00a0 Toutefois,\u00a0 le principe des id\u00e9es que nous allons expos\u00e9 est transposable \u00e0 d\u2019autres domaines de recherche et d\u2019enseignement.<\/p>\n<p><span class=\"c5\"><span class=\"c4\"><strong>I. Activit\u00e9s des r\u00e9unions de laboratoire<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>Les activit\u00e9s des r\u00e9unions de Laboratoire (Lab meeting) d\u2019un groupe dans un Institut de Recherche, concernent principalement les th\u00e8mes scientifiques sp\u00e9cifiques \u00e0 l\u2019entit\u00e9 de recherche. Un groupe de recherche est g\u00e9n\u00e9ralement constitu\u00e9 de membres seniors et de plusieurs jeunes collaborateurs (Masters, Ing\u00e9nieurs, Doctorants, Post-Doctorants). Le nombre total des membres est de l\u2019ordre de 10 \u00e0 15 personnes au maximum. Pour les ateliers ou cours de formation, le groupe peut \u00eatre plus important avec 20 \u00e0 25 participants.<\/p>\n<p>Les activit\u00e9s des r\u00e9unions de Laboratoire concernent entre autres le suivi: (i) de la litt\u00e9rature scientifique relative aux th\u00e8mes de recherche du groupe, (ii) la pr\u00e9paration des publications des membres du groupe, (iii) la participation des membres aux congr\u00e8s, conf\u00e9rences ou workshops, (iv) la pr\u00e9paration et l\u2019analyse des projets sp\u00e9cifiques de chaque membre du groupe.<\/p>\n<p>Tous ces points impliquent des comp\u00e9tences av\u00e9r\u00e9es des participants \u00e0 la lecture3, \u00e0 l\u2019\u00e9criture4, 5,6 et \u00e0 la pr\u00e9sentation orale7 de documents scientifiques. Dans ce qui suit nous allons d\u00e9velopper quelques id\u00e9es et concepts qui aideront \u00e0 l\u2019organisation efficace et \u00e0 la conduite rigoureuse de ces activit\u00e9s.<\/p>\n<p><span class=\"c5\"><span class=\"c4\"><strong>II. Entrainement \u00e0 la lecture de la litt\u00e9rature scientifique<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>Un des objectifs principaux des activit\u00e9s des r\u00e9unions de laboratoire est d\u2019encourager les participants (jeunes et seniors) \u00e0 lire d\u2019une mani\u00e8re critique la litt\u00e9rature scientifique et \u00e0 \u00e9crire des synth\u00e8ses r\u00e9sumant les contenus de ces articles pour \u00e9ventuellement les pr\u00e9senter oralement aux coll\u00e8gues et membres de l\u2019\u00e9quipe.<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><span class=\"c6\"><strong>II.1 Importance du suivi de la litt\u00e9rature scientifique<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>En prenant en exemple la Bioinformatique et la G\u00e9nomique qui sont des domaines scientifiques \u00e0 \u00e9volution tr\u00e8s rapide, les chercheurs et enseignants impliqu\u00e9s dans ces domaines doivent suivre cette \u00e9volution pour \u00eatre \u00e0 jour dans leurs connaissances.<\/p>\n<p>Pour les jeunes, il est imp\u00e9ratif de suivre r\u00e9guli\u00e8rement la litt\u00e9rature scientifique relative \u00e0 leur domaine de recherche, publi\u00e9e chaque semaine, t\u00e2che aujourd\u2019hui facilit\u00e9e par l\u2019accessibilit\u00e9 on-line de tous les journaux.<\/p>\n<p>Les journaux prestigieux et de haut-niveau, qui publient une importante litt\u00e9rature scientifique, offrent la possibilit\u00e9 de recevoir r\u00e9guli\u00e8rement par e-mail, les TOCs (Table Of Contents, Table des Mati\u00e8res ou des Contenus) du num\u00e9ro qui est publi\u00e9 dans la semaine ou le mois. Il suffit de se connecter au site Web du journal et d\u2019inscrire son adresse e-mail pour recevoir les TOCs (voir plus bas une liste de ces journaux) permettant ainsi \u00e0 l\u2019utilisateur de recevoir les titres des articles publi\u00e9s. En se connectant au journal, l\u2019utilisateur a la possibilit\u00e9 de lire le r\u00e9sum\u00e9 de chacun des articles du num\u00e9ro en cours.<\/p>\n<p>Pour l\u2019acc\u00e8s \u00e0 la totalit\u00e9 de l\u2019article, notons qu\u2019actuellement il y a deux types de journaux : journaux \u00e0 acc\u00e8s totalement libre et journaux \u00e0 acc\u00e8s mixte (libre et payant). Pour l\u2019acc\u00e8s libre ce sont les auteurs qui payent les frais de publication sur leur budget de recherche.<\/p>\n<p>N\u00e9anmoins, il y a de plus en plus de journaux qui optent pour l\u2019acc\u00e8s libre \u00e0 toutes leurs publications (\u00ab Open Access \u00bb total). Les articles publi\u00e9s dans ces journaux sont donc enti\u00e8rement accessibles \u00e0 tout utilisateur. M\u00eame les journaux \u00e0 acc\u00e8s mixte permettent g\u00e9n\u00e9ralement un acc\u00e8s libre \u00e0 un bon nombre de leurs articles. Le libre acc\u00e8s fait partie de la politique \u00e9ditoriale d\u2019un nombre de plus en plus important de journaux, encourag\u00e9s en cela par l\u2019exigence de certaines Institutions d\u2019imposer l\u2019acc\u00e8s libre aux publications relatives aux projets de recherche financ\u00e9s par des fonds publics, afin de permettre la diffusion libre la plus large des r\u00e9sultats de la recherche. Cette initiative est connue sous la d\u00e9nomination de Plan S. et va devenir, en principe, obligatoire \u00e0 partir du 1er Janvier, 2021 (voir <a href=\"https:\/\/www.coalition-s.org\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/www.coalition-s.org<\/a>).<\/p>\n<p>Ceci est une opportunit\u00e9 que doivent saisir tous les chercheurs des pays en voie de d\u00e9veloppement : avoir acc\u00e8s \u00e0 une publication scientifique en m\u00eame temps que les chercheurs des pays d\u00e9velopp\u00e9s. De plus, les publications innovantes sont g\u00e9n\u00e9ralement pr\u00e9c\u00e9d\u00e9es d\u2019articles \u00e0 acc\u00e8s libre de pr\u00e9sentation par des pairs qui introduisent l\u2019objet des sujets de recherche en question et mettent en valeur leurs apports sp\u00e9cifiques ; ceci facilite la lecture et la compr\u00e9hension de ces articles.<\/p>\n<p>Les articles payants peuvent n\u00e9anmoins \u00eatre accessibles via les Universit\u00e9s et les\u00a0 Institutions qui s\u2019abonnent \u00e0 certains journaux, ou via certains sites qui h\u00e9bergent les manuscrits soumis \u00e0 des journaux (comme BiorXiv (https:\/\/www.biorxiv.org) \u00e0 l\u2019International et HAL (<a href=\"https:\/\/hal-pasteur.archives-ouvertes.fr\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/hal-pasteur.archives-ouvertes.fr<\/a>) en France, ou le cas \u00e9ch\u00e9ant en demandant directement \u00e0 l\u2019auteur une copie de son article. Notez aussi que plusieurs journaux optent, sous certaines conditions, pour le libre acc\u00e8s aux lecteurs bas\u00e9s dans des pays en voie de d\u00e9veloppement. Ainsi l\u2019acc\u00e8s \u00e0 l\u2019article entier est imm\u00e9diatement possible s\u2019il est en acc\u00e8s libre ou peut n\u00e9cessiter une recherche suppl\u00e9mentaire comme indiqu\u00e9 plus haut via l\u2019auteur lui-m\u00eame ou un site public de d\u00e9p\u00f4t.<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><span class=\"c6\"><strong>II.2 Choix des journaux pour recevoir les TOCs<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>Chaque utilisateur fait le choix de s\u2019inscrire pour les TOCs en fonction de ses int\u00e9r\u00eats et de sa disponibilit\u00e9. Il suffit de se connecter au site Web du journal et d\u2019ins\u00e9rer son adresse e-mail pour recevoir les TOCs. Dans notre domaine nous proposons une liste restreinte de journaux prestigieux que chacun peut faire \u00e9voluer en fonction de ses lectures. Des journaux \u00e0 acc\u00e8s mixte qui traitent de tous les domaines scientifiques\u00a0 nature (<a href=\"https:\/\/www.nature.com\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/www.nature.com<\/a>) et Science (<a href=\"https:\/\/science.sciencemag.org\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/science.sciencemag.org<\/a>) ou de diff\u00e9rents domaines de la biologie comme indiqu\u00e9 dans le titre du journal:<\/p>\n<p>Nature Reviews Genetics (<a href=\"https:\/\/www.nature.com\/nrg\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/www.nature.com\/nrg\/<\/a>), nature Reviews Microbiology (<a href=\"https:\/\/www.nature.com\/nrmicro\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/www.nature.com\/nrmicro\/<\/a>), Genome Research (<a href=\"https:\/\/genome.cshlp.org\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/genome.cshlp.org<\/a>).<\/p>\n<p>Des journaux \u00e0 acc\u00e8s totalement libre:<\/p>\n<p class=\"c7\"><span class=\"c3\"><strong>\u2022<\/strong><\/span> Plos Computational Biology (<a href=\"http:\/\/journals.plos.org\/ploscompbiol\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">http:\/\/journals.plos.org\/ploscompbiol\/<\/a>),<\/p>\n<p class=\"c7\"><span class=\"c3\"><strong>\u2022<\/strong><\/span> Plos Biology (<a href=\"https:\/\/journals.plos.org\/plosbiology\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/journals.plos.org\/plosbiology\/<\/a>),<\/p>\n<p class=\"c7\"><span class=\"c3\"><strong>\u2022<\/strong><\/span> Plos Genetics (<a href=\"https:\/\/journals.plos.org\/plosgenetics\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/journals.plos.org\/plosgenetics\/<\/a>),<\/p>\n<p class=\"c7\"><span class=\"c3\"><strong>\u2022<\/strong><\/span> BMC Biology (<a href=\"http:\/\/genomebiology.com\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">http:\/\/genomebiology.com<\/a>),<\/p>\n<p class=\"c7\"><span class=\"c3\"><strong>\u2022<\/strong><\/span> BMC Genomics (<a href=\"https:\/\/bmcgenomics.biomedcentral.com\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/bmcgenomics.biomedcentral.com<\/a>),<\/p>\n<p class=\"c7\"><span class=\"c3\"><strong>\u2022<\/strong><\/span> BMC Evolutionary Biology (<a href=\"https:\/\/bmcevolbiol.biomedcentral.com\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/bmcevolbiol.biomedcentral.com<\/a>),<\/p>\n<p class=\"c7\"><span class=\"c3\"><strong>\u2022<\/strong><\/span> BMC Bioinformatics (<a href=\"https:\/\/bmcbioinformatics.biomedcentral.com\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/bmcbioinformatics.biomedcentral.com<\/a>).<\/p>\n<p>Chacun peut allonger ou raccourcir cette liste en fonction de sa disponibilit\u00e9 et de ses int\u00e9r\u00eats. Nous proposons une inscription \u00e0 un maximum de journaux quitte \u00e0 l\u2019adapter ensuite en fonction de ses int\u00e9r\u00eats personnels.<\/p>\n<p>Notez que les sites Web de ces journaux, particuli\u00e8rement nature, proposent r\u00e9guli\u00e8rement des annonces internationales d\u2019offres de position pour Post Doctorants et de travail ainsi que des conf\u00e9rences. Ces annonces sont tr\u00e8s utiles pour les jeunes qui cherchent des sujets de recherche et des laboratoires d\u2019accueil.<\/p>\n<p>Il est aussi possible d\u2019acc\u00e9der \u00e0 l\u2019actualit\u00e9 scientifique \u00e0 travers des newsletters et des blogs. Il suffit de les suivre et\/ou de s\u2019y inscrire.<\/p>\n<p>Il existe une multitude de blogs d\u2019int\u00e9r\u00eat et de contenu divers sur le suivi des publications scientifiques. Par exemple le blog (<a href=\"https:\/\/microbiomedigest.com\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/microbiomedigest.com<\/a>) est maintenu par des scientifiques du monde entier. Il liste et r\u00e9pertorie les r\u00e9f\u00e9rences aux meilleures publications scientifiques relatives aux microbiomes. Ce type de blog facilite significativement le travail de recherche relatif \u00e0 ce domaine de recherche \u00e0 \u00e9volution rapide.<\/p>\n<p>Contrairement aux TOCs qui listent la totalit\u00e9 des publications d\u2019un num\u00e9ro donn\u00e9, les newsletters ne consid\u00e8rent que les articles qu\u2019elles d\u00e9cident de commenter et qui sont g\u00e9n\u00e9ralement publi\u00e9s dans diff\u00e9rents journaux.<\/p>\n<p>Science News (https:\/\/www.sciencenews.org) est par exemple une newsletter qui analyse l\u2019actualit\u00e9 scientifique la plus pertinente de la semaine en incluant des liens vers les articles comment\u00e9s. De m\u00eame la revue nature offre la possibilit\u00e9 de recevoir hebdomadairement des news et des analyses concernant ses futures publications (en amont des TOCs) : nature Briefing (<a href=\"https:\/\/www.nature.com\/news\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/www.nature.com\/news<\/a>).<\/p>\n<p>Ces analyses sont tr\u00e8s utiles surtout pour les jeunes, car elles introduisent les objets des articles d\u2019une mani\u00e8re simplifi\u00e9e de fa\u00e7on \u00e0 faciliter la lecture des originaux.<\/p>\n<p>Notez que ces newsletters sont aussi tr\u00e8s utiles aux journalistes qui veulent commenter rigoureusement l\u2019actualit\u00e9 scientifique, particuli\u00e8rement pendant cette p\u00e9riode pour le suivi de l\u2019\u00e9volution de la recherche concernant l\u2019\u00e9volution des recherches sur la Covid-19.<\/p>\n<p><span class=\"c6\"><span class=\"c3\"><strong>II.3 Prendre l\u2019habitude de lire les TOCs et les papiers correspondants<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>Recevoir les TOCs n\u2019est pas une fin en soi. Il faut parcourir le message re\u00e7u et se connecter aux journaux pour lire au moins les r\u00e9sum\u00e9s de quelques articles. En principe les Chercheurs\/Enseignants motiv\u00e9s vont t\u00e9l\u00e9charger et lire attentivement en entier au moins un article en rapport avec leurs activit\u00e9s scientifiques. Le but recherch\u00e9 est d\u2019apprendre et de s\u2019enrichir des connaissances rapport\u00e9es dans cet article, surtout afin de se maintenir au niveau des connaissances actuelles, pour leurs travaux personnels et pour diriger correctement les travaux de leurs \u00e9tudiants et collaborateurs.<\/p>\n<p>Pour les jeunes chercheurs, lire et synth\u00e9tiser pour retenir l\u2019essentiel d\u2019un article qui vient d\u2019\u00eatre publi\u00e9 est primordial mais n\u2019est pas une t\u00e2che ais\u00e9e et n\u00e9cessite de leur part un investissement volontaire significatif et un entrainement sp\u00e9cifique3. Le cadre idoine pour ce type d\u2019entrainement est la R\u00e9union de Laboratoire o\u00f9 chaque membre pr\u00e9sente le contenu d\u2019au moins un papier lu dans la semaine et confronte les discussions et les commentaires qui suivent de telles pr\u00e9sentations.<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><span class=\"c6\"><strong>II.4 Pr\u00e9paration et pr\u00e9sentation orale de la synth\u00e8se d\u2019un article<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>Il est n\u00e9cessaire de s\u2019entrainer \u00e0 la lecture critique des articles et \u00e0 la pr\u00e9sentation orale de la synth\u00e8se de leurs contenus. A cet effet nous sugg\u00e9rons :<br \/>Pour la lecture critique d\u2019un article de (i) prendre note en marquant les phrases et les id\u00e9es cl\u00e9s ; (ii) lister les r\u00e9sultats essentiels rapport\u00e9s et les m\u00e9thodes utilis\u00e9es ; (iii) noter tous les points qui n\u00e9cessitent des \u00e9claircissements plus pouss\u00e9s ; (iv) collecter l\u2019ensemble des notes pour \u00e9crire un premier brouillon de la synth\u00e8se de l\u2019article ; (v) r\u00e9\u00e9crire, restructurer et repenser ce premier brouillon avec ses propres mots pour am\u00e9liorer la qualit\u00e9 de la synth\u00e8se.<\/p>\n<p>La pr\u00e9sentation orale exige la pr\u00e9paration attentive d\u2019une structure logique pour la synth\u00e8se \u00e9crite en s\u2019assurant que les id\u00e9es importantes sont report\u00e9es dans un ordre logique et sans r\u00e9p\u00e9tition. Cette pr\u00e9sentation suit souvent, un plan structur\u00e9 contenant (i) une introduction g\u00e9n\u00e9rale expliquant le choix et le contexte de l\u2019objet de l\u2019article, (ii) une r\u00e9capitulation des r\u00e9sultats importants et des id\u00e9es trait\u00e9s, (iii) des m\u00e9thodes introduites dans l\u2019article analys\u00e9 et (iii) une conclusion incluant les messages \u00e0 retenir et leurs perspectives. Il est tr\u00e8s important d\u2019\u00e9viter le plagiat (le couper-coller de paragraphes de texte, de figures et tableaux) et de ne consid\u00e9rer que son\u00a0 propre texte et illustration.<\/p>\n<p>Notez que la pr\u00e9paration d\u2019un document visuel (PowerPoint par exemple) n\u00e9cessite un entrainement pr\u00e9alable pour le choix des caract\u00e8res \u00e0 utiliser pour le texte, leurs tailles, les couleurs \u00e0 consid\u00e9rer, la quantit\u00e9 de texte \u00e0 inclure dans une diapositive, (voir par exemple : <a href=\"https:\/\/www.youtube.com\/watch?v=1fs_jqXGs8s\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/www.youtube.com\/watch?v=1fs_jqXGs8s<\/a>). Il est primordial de savoir pr\u00e9parer le document visuel et surtout de savoir comment le pr\u00e9senter \u00e0 une audience donn\u00e9e sans perdre son attention par des diapositives illisibles ou par une pr\u00e9sentation monotone7. Quelques recommandations \u00e0 respecter : (i) \u00e9viter les diapositives surcharg\u00e9es en texte, ou figures invisibles, (ii) \u00e9viter les animations inutiles ou fantaisistes, (iii) ne pas prendre les figures de vulgarisation des sites web (iv) l\u2019ordre et le d\u00e9filement des id\u00e9es et des diapositives doivent \u00eatre raisonnables et attractifs, et\u00a0 (v) limiter le nombre et le temps des diapositives.\u00a0<\/p>\n<p>La maitrise de la communication visuelle et le talent pour exposer des informations sont des comp\u00e9tences importantes. Cependant, rares sont les scientifiques qui ont re\u00e7u formellement un entrainement pour les maitriser, d\u2019o\u00f9 l\u2019importance de la pr\u00e9sentation et de l\u2019analyse critique d\u2019articles lors de l\u2019organisation des r\u00e9unions de laboratoire et leur bon d\u00e9roulement.<\/p>\n<p><span class=\"c4\"><span class=\"c5\"><strong>III. Organisation et supervision des r\u00e9unions de laboratoire<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>Les pr\u00e9parations des projets et des pr\u00e9sentations orales d\u00e9clenchent souvent des discussions qui doivent \u00eatre initi\u00e9es et coordonn\u00e9es de pr\u00e9f\u00e9rence par des coll\u00e8gues exp\u00e9riment\u00e9(e)s.<\/p>\n<p><span class=\"c6\"><span class=\"c3\"><strong>III.1 D\u00e9velopper l\u2019\u00e9change scientifique et les comp\u00e9tences d\u2019argumentation<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>L\u2019argumentation et les discussions scientifiques sont des processus cl\u00e9s dans l\u2019apprentissage et l\u2019\u00e9valuation des nouvelles id\u00e9es et des nouveaux concepts. Les expos\u00e9s relatifs \u00e0 un travail personnel ou suite \u00e0 la lecture d\u2019un article sont l\u2019occasion d\u2019un questionnement, d\u2019un dialogue et de commentaires enrichissants. Il faut encourager et inciter les participants \u00e0 s\u2019engager pour commenter et poser des questions lors des expos\u00e9s en r\u00e9union de laboratoire ainsi que lors des cours et des travaux pratiques en g\u00e9n\u00e9ral. Il faut insister sur l\u2019importance de la prise de parole, de l\u2019\u00e9coute des autres et de l\u2019implication dans l\u2019argumentation comme moyen d\u2019apprendre et de d\u00e9velopper des comp\u00e9tences analytiques.<\/p>\n<p>Bien qu\u2019une ambiance conviviale pr\u00e9vale lors des r\u00e9unions de laboratoire, les participants doivent aussi donner des preuves et des raisons de mani\u00e8re organis\u00e9e, de fa\u00e7on \u00e0 permettre \u00e0 chacun d\u2019exprimer son opinion et d\u2019\u00e9couter les autres. De m\u00eame, pour \u00e9viter les pol\u00e9miques st\u00e9riles,\u00a0 les critiques et arguments doivent \u00eatre bas\u00e9s sur des publications scientifiques et des r\u00e9sultats exp\u00e9rimentaux et non sur des croyances.<\/p>\n<p>Toutes ces pratiques ont un impact positif sur l\u2019am\u00e9lioration de l\u2019\u00e9criture et la pr\u00e9sentation des synth\u00e8ses et surtout sur l\u2019assurance et la confiance en soi ainsi que sur le d\u00e9veloppement des comp\u00e9tences et de l\u2019efficience de l\u2019\u00e9quipe.\u00a0<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><span class=\"c6\"><strong>III.2 Fr\u00e9quence de l\u2018organisation des r\u00e9unions de laboratoire<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>L\u2019organisation doit \u00eatre r\u00e9guli\u00e8re un jour fix\u00e9 de la semaine, afin de garder l\u2019int\u00e9r\u00eat et l\u2019attention des participants. Il est hautement recommand\u00e9 de consacrer au moins une demi-journ\u00e9e par semaine \u00e0 la r\u00e9union de laboratoire, afin de suivre la progression des travaux des membres du groupe et surtout d\u2019assurer le suivi de la litt\u00e9rature selon les TOCs qu\u2019on re\u00e7oit chaque semaine. Il est utile de souligner l\u2019importance des r\u00e9unions r\u00e9guli\u00e8res de laboratoire pour exposer l\u2019\u00e9tat d\u2019avancement de ses propres travaux et pour \u00e9changer rigoureusement avec les autres. C\u2019est aussi une occasion d\u2019apprendre des nouveaut\u00e9s scientifiques \u00e0 partir des expos\u00e9s des coll\u00e8gues. La r\u00e9union doit \u00eatre un rendez-vous attractif pour apprendre, s\u2019entrainer et aussi pour communiquer aux autres des informations importantes. Ces activit\u00e9s permettent aux chercheurs d\u2019\u00e9viter l\u2019isolement et d\u2019\u00eatre membre d\u2019une \u00e9quipe solidaire.<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><span class=\"c6\"><strong>III.3 Animation des activit\u00e9s des r\u00e9unions de laboratoire<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>En principe les activit\u00e9s des r\u00e9unions de laboratoire sont organis\u00e9es sans contraintes majeures sur le contenu, le timing et les discussions abord\u00e9es. Mais pour une bonne efficacit\u00e9, il est n\u00e9cessaire de diriger ces activit\u00e9s par un(e) Chercheur(e) \/ Enseignant(e) exp\u00e9riment\u00e9(e). Diriger est d\u00e9cisif d\u00e8s qu\u2019il y a interventions multiples des participants, pour garder\u00a0 le caract\u00e8re amical, courtois, ouvert et flexible de la r\u00e9union.<\/p>\n<p>L\u2019animateur de la r\u00e9union assure l\u2019aide n\u00e9cessaire aux participants pour lire et synth\u00e9tiser efficacement les articles, pour pr\u00e9parer et d\u00e9livrer les pr\u00e9sentations orales et surtout pour encourager les discussions et le partage des id\u00e9es en s\u2019assurant que chacun participe effectivement aux activit\u00e9s de la r\u00e9union, en encourageant si n\u00e9cessaire, certains \u00e0 poser des questions ou \u00e0 faire des commentaires et en limitant les interventions excessives.<\/p>\n<p>L\u2019animateur de la r\u00e9union doit guider les participants dans la lecture critique des publications r\u00e9centes en les \u00e9clairant par exemple sur l\u2019\u00e9volution graduelle des connaissances et des technologies qui ont amen\u00e9 au contenu de l\u2019article r\u00e9cent. Il doit faire attention au raisonnement logique et rigoureux des participants. Il peut, si n\u00e9cessaire, proposer la lecture de r\u00e9f\u00e9rences compl\u00e9mentaires y compris des articles fondamentaux ou des guides qui permettent de donner le contexte et facilitent la lecture des articles actuels.<\/p>\n<p>L\u2019animateur veillera \u00e0 ce que les participants se concentrent sur les domaines de leurs \u00e9tudes (ici Bioinformatique et G\u00e9nomique) et \u00e9vitent les improvisations et les tentatives de dispersion. Il a une responsabilit\u00e9 majeure pour \u00e9duquer les participants \u00e0 respecter les r\u00e8gles d\u2019\u00e9thique et l\u2019int\u00e9grit\u00e9 scientifique, comme par exemple veill\u00e9 \u00e0 la rigueur scientifique et \u00e0 exclure tout plagiat8, 9.<\/p>\n<p>Il contribuera \u00e0 la formation des participants pour communiquer des documents \u00e9crits et oraux bien structur\u00e9s et les aider \u00e0 d\u00e9velopper des comp\u00e9tences d\u2019argumentation concernant les concepts et les th\u00e8mes d\u00e9velopp\u00e9s tout le long des r\u00e9unions.<\/p>\n<p>De ce point de vue, il est important que les Chercheurs et Enseignants seniors soient \u00e0 jour dans les connaissances de leurs domaines de recherche, afin d\u2019orienter et de diriger correctement les travaux des jeunes de leurs laboratoires et pour les garder au niveau des connaissances actualis\u00e9es.<\/p>\n<p>Notez aussi qu\u2019il est souhaitable d\u2019\u00e9tablir une animation tournante des membres du groupe afin d\u2019assurer un enthousiasme et une motivation continue pendant les r\u00e9unions.<\/p>\n<p><span class=\"c6\"><span class=\"c3\"><strong>III.4 Organisation des ateliers d\u2019apprentissage \u00e0 l\u2019\u00e9criture scientifique<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>Ecrire une publication scientifique exige des r\u00e9sultats structur\u00e9s et un effort de r\u00e9flexion et de r\u00e9daction. Une formation et un entrainement sp\u00e9cifiques sont n\u00e9cessaires avant de produire un manuscrit. Plusieurs sites Web offrent des guides \u00e0 l\u2019apprentissage et des tutoriaux sur l\u2019\u00e9criture scientifique (voir par exemple : <a href=\"https:\/\/www.springernature.com\/gp\/authors\/campaigns\/writing-a-manuscript\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/www.springernature.com\/gp\/authors\/campaigns\/writing-a-manuscript<\/a>). Ceci suppose de maitriser auparavant la langue anglaise. C\u2019est donc une t\u00e2che de longue haleine qui n\u00e9cessite de la patience et de la pers\u00e9v\u00e9rance. En principe un s\u00e9jour prolong\u00e9 dans une \u00e9quipe scientifique de haut niveau, lors d\u2019une pr\u00e9paration de th\u00e8se ou d\u2019un Post Doctorat, permet une formation ad\u00e9quate \u00e0 l\u2019\u00e9criture scientifique. C\u2019est le cursus suivi par la majorit\u00e9 des chercheurs seniors actuels. De nos jours l\u2019acc\u00e8s \u00e0 ces grands laboratoires passe par un processus de s\u00e9lection qui implique entre autre une pr\u00e9sentation orale de son projet et souvent une liste de travaux d\u00e9j\u00e0 publi\u00e9s.<\/p>\n<p>Ainsi pour acc\u00e9l\u00e9rer cette formation, il est d\u2019une grande utilit\u00e9 d\u2019organiser des ateliers d\u2019apprentissage \u00e0 l\u2019\u00e9criture scientifique au sein des Universit\u00e9s et des Institutions de recherche. On peut faire appel \u00e0 des enseignants sp\u00e9cialis\u00e9s dans ces domaines ou aux chercheurs exp\u00e9riment\u00e9s qui ont acquis une exp\u00e9rience prouv\u00e9e \u00e0 l\u2019\u00e9criture surtout parmi ceux qui ont fr\u00e9quent\u00e9 les laboratoires internationaux. Dans la comp\u00e9tition actuelle, les universit\u00e9s avanc\u00e9es organisent leurs structures d\u2019\u00e9dition, formation, pr\u00e9paration, publications scientifiques, protection de la propri\u00e9t\u00e9 intellectuelle et de diffusion de l\u2019information scientifique.\u00a0<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><span class=\"c6\"><strong>III.5 Cas des r\u00e9unions de laboratoire pendant les cours<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>L\u2019inclusion des activit\u00e9s type r\u00e9union de laboratoire dans le programme d\u2019un cours, requiert le d\u00e9veloppement des activit\u00e9s d\u00e9j\u00e0 pr\u00e9sent\u00e9es ci-dessus, avec en plus la pr\u00e9paration pr\u00e9alable, par l\u2019animateur, de documents scientifiques (type articles publi\u00e9s, conf\u00e9rences, cours en vid\u00e9o) qui int\u00e8grent le programme du cours1. Ces documents, utilis\u00e9s pendant les r\u00e9unions de Laboratoire, peuvent servir comme point de d\u00e9part des projets de recherche bibliographique: chaque participant choisit son th\u00e8me de recherche et produit une revue de ces travaux synth\u00e9tisant les contenus de publications relatives \u00e0 ce th\u00e8me. Les revues finales pourront faire l\u2019objet d\u2019une pr\u00e9sentation formelle orale et d\u2019un document \u00e9crit \u00e0 la fin du cours10 et m\u00eame pour les plus brillants d\u2019une publication dans un journal scientifique.<\/p>\n<p>Comme le nombre de participants \u00e0 un cours national ou international, est plus \u00e9lev\u00e9 que pour un groupe de recherche et afin de permettre \u00e0 chacun de s\u2019exprimer dans de bonnes conditions, il serait recommandable de r\u00e9server dans le programme du cours, une journ\u00e9e enti\u00e8re par semaine aux activit\u00e9s des r\u00e9unions de laboratoire.<\/p>\n<p><span class=\"c5\"><span class=\"c4\"><strong>IV. Conclusion<br \/><\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p>Notre exp\u00e9rience acquise, lors de nos propres r\u00e9unions de laboratoires et\u00a0 lors de celles que nous avons incluses dans les programmes des cours de Bioinformatique et G\u00e9nomique\u00a0 organis\u00e9s \u00e0 l\u2019Institut Pasteur de Tunis, Universit\u00e9 de Tunis El Manar1,10, a montr\u00e9 un apport important\u00a0 dans l\u2019\u00e9ducation des jeunes doctorants et post-doctorants\u00a0 pour acqu\u00e9rir des comp\u00e9tences de lecture, d\u2019\u00e9criture, de pr\u00e9sentation publique de leurs travaux, de l\u2019assurance et de la confiance en soi. Le suivi de l\u2019actualit\u00e9 scientifique et l\u2019analyse critique des articles publi\u00e9s sont des facteurs utiles pour le d\u00e9veloppement des comp\u00e9tences des jeunes chercheurs. De m\u00eame, par le travail en \u00e9quipe, ils acqui\u00e8rent une exp\u00e9rience significative de dialogue, de discussion et d\u2019\u00e9changes d\u2019argumentation. Les r\u00e9unions de laboratoire, par les pr\u00e9sentations des diff\u00e9rentes lectures de l\u2019actualit\u00e9 scientifique via les TOCs, contribuent \u00e0 un enrichissement collectif des participants.<\/p>\n<p>Ces activit\u00e9s studieuses et informelles se passent dans une ambiance passionnante mais rigoureuse et engendrent forc\u00e9ment une surcharge de travail pour les participants, ceux-ci sont r\u00e9compens\u00e9s par l\u2019impact positif qu\u2019elles induisent sur leurs profils personnels et sur les autres activit\u00e9s du Laboratoire ou du cours. Elles conduisent \u00e0 une attitude d\u2019\u00e9quipe interactive et solidaire envers une recherche scientifique \u00e0 la fois sp\u00e9cifique, th\u00e9matique et de groupe.<\/p>\n<p>Finalement, nous encourageons tous nos coll\u00e8gues de l\u2019Universit\u00e9 et des Instituts de Recherche \u00e0 promouvoir la culture de l\u2019excellence des R\u00e9unions de Laboratoire. C\u2019est une activit\u00e9 utile pour la Science, la formation des jeunes Chercheurs et Enseignants et pour l\u2019acquisition des comp\u00e9tences et la motivation \u00e0 la lecture, l\u2019\u00e9criture et la communication. Elle permet aussi d\u2019engager des \u00e9changes rigoureux et r\u00e9gulier de l\u2019information et de la culture scientifique permettant une comp\u00e9tition saine entre chercheurs et \u00e9quipes. La pr\u00e9sentation de publications et travaux en r\u00e9unions r\u00e9guli\u00e8res permettent aussi aux jeunes chercheurs d\u2019acqu\u00e9rir l\u2019assurance et la confiance en soi.<\/p>\n<p>Ces activit\u00e9s facilitent aussi l\u2019organisation d\u2019ateliers ou workshops de formation, de pr\u00e9sentation de travaux et r\u00e9sultats de recherche dans le cadre de journ\u00e9es scientifiques de laboratoire, d\u2019\u00e9cole doctorale et ou de l\u2019institution universitaire.\u00a0\u00a0\u00a0<\/p>\n<p>Notons, qu\u2019avec l\u2019enseignement \u00e0 distance et la disponibilit\u00e9 on-line de cours et des pr\u00e9sentations faites lors des conf\u00e9rences ou symposiums internationaux, les activit\u00e9s en groupe type r\u00e9union de laboratoire peuvent aider \u00e0 mieux les suivre et \u00e0 en profiter quand on est entrain\u00e9 \u00e0 commenter les expos\u00e9s et \u00e0 questionner les pr\u00e9sentateurs.<\/p>\n<p><span class=\"c5\"><span class=\"c4\"><strong>V. R\u00e9f\u00e9rences<\/strong><\/span><\/span><\/p>\n<p><span class=\"c3\"><strong>1.<\/strong><\/span> Boudabous A, Tekaia F. (2020). Enhancing Bioinformatics and Genomics Courses: Building Capacity and Skills via Lab Meeting Activities.<br \/>Bioessays. 2020 Oct; 42(10):e2000134. doi: 10.1002\/bies.202000134.<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><strong>2.<\/strong><\/span> Guerfali FZ, Laouini D, Boudabous A, Tekaia F.\u00a0 (2019). Designing and running an advanced Bioinformatics and Genome analyses course in Tunisia.<br \/>PLoSComput Biol. 2019 Jan 28;15(1):e1006373. doi: 10.1371\/journal.pcbi.1006373.<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><strong>3.<\/strong><\/span> M\u00e9ndez M. (2018). Ten simple rules for developing good reading habits during graduate school and beyond.<br \/>PLoS Comput Biol. 14(10): e1006467.doi: 10.1371\/journal.pcbi.1006467.<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><strong>4.<\/strong><\/span> Pautasso M. (2013). Ten simple rules for writing a literature review.<br \/>PLoS Comput Biol. 9(7):e1003149. doi: 10.1371\/journal.pcbi.1003149.<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><strong>5.<\/strong><\/span> Zhang W. (2014). Ten simple rules for writing research papers.<br \/>PLoSComput Biol. 10(1):e1003453. doi: 10.1371\/journal.pcbi.1003453.<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><strong>6.<\/strong><\/span> Mensh B, Kording K. (2017). Ten simple rules for structuring papers<br \/>PLoS Comput Biol. 13(9):e1005619. doi: 10.1371\/journal.pcbi.1005619.<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><strong>7.<\/strong><\/span> Lortie CJ. (2017). Ten simple rules for short and swift presentations.<br \/>PLoSComput Biol. 13(3):e1005373. doi: 10.1371\/journal.pcbi.1005373<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><strong>8.<\/strong><\/span> Brainard J. (2018). Rethinking retractions.<br \/>Science. 362(6413):390-393. doi: 10.1126\/science.362.6413.390.<\/p>\n<p><span class=\"c3\"><strong>9.<\/strong><\/span> Retraction watch database:<br \/><a href=\"http:\/\/retractiondatabase.org\/RetractionSearch.aspx?\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">http:\/\/retractiondatabase.org\/RetractionSearch.aspx?<\/a><\/p>\n<p>10. Programmes d\u00e9taill\u00e9s des cours incluants les activit\u00e9s des r\u00e9unions de laboratoire : <a href=\"https:\/\/webext.pasteur.fr\/tekaia\/BCGAIPT2017\/BCGAIPT2017_Prog.html\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">https:\/\/webext.pasteur.fr\/tekaia\/BCGAIPT2017\/BCGAIPT2017_Prog.html<\/a><\/p>\n<p><span class=\"c3\"><strong>Auteurs<\/strong><\/span><\/p>\n<p><strong>Fredj Tekaia<\/strong><br \/><span class=\"c2\"><em>Chercheur invit\u00e9<br \/>Institut Pasteur Paris<br \/>25, rue du Dr. Roux<br \/>75724 Paris cedex 15\u00a0\u00a0\u00a0 France<\/em><\/span><a href=\"http:\/\/%20https:\/\/webext.pasteur.fr\/tekaia\/BGA_courses.html\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\"><span class=\"c2\"><em><br \/>https:\/\/webext.pasteur.fr\/tekaia\/BGA_courses.html<\/em><\/span><\/a><\/p>\n<p><strong>Abdellatif Boudabous<\/strong><br \/><em><span class=\"c2\">Professeur Em\u00e9rite<br \/>Universit\u00e9 Tunis El Manar, Facult\u00e9 des Sciences de Tunis,<br \/>Laboratoire Microorganisme et Biomol\u00e9cules Actives,<br \/>Campus Universitaire Farhat Hached, 2092 Tunis, Tunisie<br \/>E-mail : Abdellatif.chihi@mes.rnu.tn<br \/><\/span><\/em><\/p>\n<p>Auteur:<br \/>\n<a href=\"https:\/\/www.leaders.com.tn\/article\/30804-importance-des-reunions-de-laboratoire-pour-le-developpement-des-competences-en-recherche-scientifique\">Cliquez ici pour lire l&rsquo;article depuis sa source.<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Par Fredj Tekaia et Abdellatif Boudabous &#8211; La publication des r\u00e9sultats d\u2019un travail scientifique est une \u00e9tape vitale dans le d\u00e9veloppement du cursus d\u2019un chercheur. Il lui est n\u00e9cessaire de (i) lire et analyser la litt\u00e9rature scientifique dans les meilleurs journaux, (ii) pr\u00e9senter oralement son propre travail ou les contenus de ses lectures afin d\u2019enrichir [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1772,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"fifu_image_url":"","fifu_image_alt":"","footnotes":""},"categories":[73,55],"tags":[],"class_list":["post-102959","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-actualite","category-tunisie"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/102959","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1772"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=102959"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/102959\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=102959"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=102959"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=102959"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}