{"id":112477,"date":"2021-03-04T05:06:13","date_gmt":"2021-03-04T10:06:13","guid":{"rendered":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/pr-salima-bouzghoub-chef-de-departement-de-virologie-a-lipa-une-derniere-technologie-de-sequencage-sera-prochainement-fonctionnelle-a-lipa\/"},"modified":"2021-03-04T05:06:13","modified_gmt":"2021-03-04T10:06:13","slug":"pr-salima-bouzghoub-chef-de-departement-de-virologie-a-lipa-une-derniere-technologie-de-sequencage-sera-prochainement-fonctionnelle-a-lipa","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/linitiative.ca\/International\/pr-salima-bouzghoub-chef-de-departement-de-virologie-a-lipa-une-derniere-technologie-de-sequencage-sera-prochainement-fonctionnelle-a-lipa\/","title":{"rendered":"Pr Salima Bouzghoub. Chef de d\u00e9partement de virologie \u00e0 l\u2019IPA : \u00abUne derni\u00e8re technologie de s\u00e9quen\u00e7age sera prochainement fonctionnelle \u00e0 l\u2019IPA\u00bb"},"content":{"rendered":"

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\"\"\/ Salima Bouzghoub – Photo : B. Souhil<\/span><\/div>\n

\u2013 La laboratoire de la grippe et des virus respiratoires est \u00e9rig\u00e9 en Centre national de r\u00e9f\u00e9rence depuis 2005. Quelles sont les activit\u00e9s de ce laboratoire\u00a0?<\/span><\/strong><\/em><\/p>\n

Le laboratoire regroupe<\/span> quatre unit\u00e9s, qui portent sur diff\u00e9rents domaines d\u2019activit\u00e9 de diagnostic et de recherche. Il y a les cultures cellulaires et isolements, biologie mol\u00e9culaire des virus respiratoires et une unit\u00e9 de surveillance de la r\u00e9sistance aux antiviraux, cette derni\u00e8re a \u00e9t\u00e9 retenue comme candidate par l\u2019OMS, lors de la visite d\u2019experts en 2015, comme centre d\u2019excellence pour les activit\u00e9s \u00e0 l\u2019\u00e9chelle r\u00e9gionale. Le laboratoire assure les activit\u00e9s de diagnostic, la recherche et la formation. D\u2019ailleurs lors de cette \u00e9pid\u00e9mie, des cycles de formation ont \u00e9t\u00e9 organis\u00e9s pour le diagnostic du Sars-Cov-2 notamment sur les m\u00e9thodes sp\u00e9cifiques \u00e0 ce virus.<\/span><\/p>\n

\u2013 Des s\u00e9quen\u00e7age du sars-cov-2 sont effectu\u00e9s depuis quelques mois. Qu\u2019en est-il\u00a0?<\/strong><\/span><\/em><\/p>\n

Effectivement, nous avons proc\u00e9d\u00e9 au s\u00e9quen\u00e7age du virus et plusieurs mutations ont \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9es, mais elles n\u2019avaient pas d\u2019impact sur l\u2019activit\u00e9 du virus. Nous avons adopt\u00e9 une strat\u00e9gie de s\u00e9quen\u00e7age \u00e0 travers le screening de la PCR positive.<\/span><\/p>\n

C\u2019est \u00e0 ce niveau-l\u00e0 que le recours au s\u00e9quen\u00e7age est indiqu\u00e9 pour chercher les mutations. Le r\u00e9sultats d\u2019une PCR positive avec g\u00e8ne S n\u00e9gatif suscite des doutes. Elle sera donc soumise \u00e0 une deuxi\u00e8me \u00e9tape d\u2019examen pour le s\u00e9quencage de fragments afin d\u2019identifier les mutations<\/span>.<\/span> Le s\u00e9quen\u00e7age consiste \u00e0 d\u00e9terminer l\u2019ordre d\u2019encha\u00eenement des nucl\u00e9otides d\u2019un fragment d\u2019ADN donn\u00e9, et nous utilisons la m\u00e9thode de Sanger. Mais bient\u00f4t un nouvel \u00e9quipement sera r\u00e9ceptionn\u00e9 et nous permettra de d\u00e9tecter les mutations sp\u00e9cifiques en peu de temps. Cette nouvelle technologie nous permet de faire un travail complet en un temps record.<\/span><\/p>\n

\u2013 Quel est l\u2019objectif du s\u00e9quencage\u00a0?<\/span><\/strong><\/em><\/p>\n

Lors d\u2019une \u00e9pid\u00e9mie, les donn\u00e9es permettant de comprendre la biologie du virus et son \u00e9volution sont essentielles pour la compr\u00e9hension de sa propagation, surveiller l\u2019apparition des variants du virus et de potentielles modifications, sa virulence et sa contamination. La surveillance de l\u2019apparition des variants est importante pour une meilleure pr\u00e9vision de l\u2019\u00e9volution de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie. Les donn\u00e9es de s\u00e9quence du virus sont essentielles pour s\u2019assurer que les vaccins sont adapt\u00e9s aux variants du virus en cours de circulation.<\/span><\/p>\n

\u2013 Quels sont les objectifs de votre laboratoire \u00e0 l\u2019avenir\u00a0?<\/strong><\/span><\/em><\/p>\n

Nous continuerons \u00e0 travailler pour que notre laboratoire s\u2019affirme comme r\u00e9f\u00e9rent des CNR de demain, en adoptant les technologies de pointe pour le diagnostic virologique de la Covid-19 et autres virus. Comme nous poursuivrons la surveillance de la circulation des variants Sars-CoV-2, notamment le s\u00e9quen\u00e7age par NGS next g\u00e9n\u00e9ration s\u00e9quence, doubler le nombre des activit\u00e9s de recherche, d\u00e9velopper le partenariat de recherche et surtout renforcer la formation et le transfert de technologie.<\/span><\/p>\n

Post Views:<\/span> 652<\/span><\/p>\n


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Auteur: Anis Khecheba
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